61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3753 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3753  Patatin  100 
 
 		 356 aa  730    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  40.41 
 
 		 342 aa  245  8e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  35.12 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  35.84 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  32.93 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  30.93 
 
 		 365 aa  169  9e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  30.15 
 
 		 363 aa  165  9e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1002 aa  146  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  31.37 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  30.86 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  35.23 
 
 		 686 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  29.68 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  31.99 
 
 		 312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  27.73 
 
 		 390 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  33.45 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  27.79 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  26.35 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  32.34 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  32.08 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  26.7 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  27.47 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  26.28 
 
 		 366 aa  92.4  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  30.96 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  29.52 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  28.09 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  33.19 
 
 		 351 aa  89.7  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  31.87 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  31.47 
 
 		 336 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  31.47 
 
 		 336 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  25.08 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  30.74 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  28.01 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  32.51 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  28.97 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  28.48 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  29.44 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.08 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  24.48 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  26.67 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  26.67 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  26.67 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  23.31 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  28.51 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  31.62 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  25.42 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  26.83 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  25.09 
 
 		 714 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  25.82 
 
 		 2272 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  25.76 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  25.53 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  24.79 
 
 		 1678 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  27.97 
 
 		 615 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  24.13 
 
 		 1113 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  26.02 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>