86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4663 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4663  patatin  100 
 
 		 333 aa  679    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  42.94 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  33.43 
 
 		 366 aa  156  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  33.33 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  33.07 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  35.5 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  35.5 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  35.5 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  34.46 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  35.03 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  29.97 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  32.32 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  31.56 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  32.46 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  32.24 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  29.31 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  35.42 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  35.59 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  28.48 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  31.53 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  32.96 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  29.9 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  27.03 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  28.78 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  26.99 
 
 		 351 aa  96.3  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  28.03 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  28.62 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  28.04 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1002 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  26.83 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  29.38 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  27.32 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  25.86 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  29.33 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  29.78 
 
 		 686 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  22.54 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  29.39 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  29.39 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  28.07 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  29.34 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  28.21 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  27.88 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  28.94 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  28.94 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  28.46 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  26.87 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  31.66 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  44.44 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  26.54 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  27.57 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  26.86 
 
 		 1678 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  30 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  27.34 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  24.86 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  27.14 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  23.67 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  30.5 
 
 		 1113 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  31.22 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  28.83 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  30.59 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  28.83 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  40.28 
 
 		 2272 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  26.83 
 
 		 392 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  26.46 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  29.36 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  28.63 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  29.55 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  27.44 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  29.95 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  29.29 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  27.27 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  27.47 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  29.22 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  25.56 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  26.98 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  26.15 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  25 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  25.11 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  25.21 
 
 		 379 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  28.16 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  30 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>