64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2320 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  99.7 
 
 
332 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  99.7 
 
 
332 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  100 
 
 
332 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  100 
 
 
397 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  99.7 
 
 
332 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  99.2 
 
 
375 aa  738    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  100 
 
 
332 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  89.19 
 
 
333 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  64.88 
 
 
336 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  64.58 
 
 
336 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  64.88 
 
 
336 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  31.38 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  31.2 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  30.95 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  30.65 
 
 
312 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  26.58 
 
 
351 aa  102  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  35.74 
 
 
344 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  32.92 
 
 
344 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  26.54 
 
 
337 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  27.59 
 
 
326 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  28.75 
 
 
320 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  32.36 
 
 
367 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  30.07 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  32.08 
 
 
343 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  34.06 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  28.57 
 
 
374 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  31.09 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  31.78 
 
 
371 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  31.78 
 
 
371 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  31.78 
 
 
371 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  30.77 
 
 
326 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  25.6 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  29.74 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  29.74 
 
 
334 aa  84  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  30.24 
 
 
336 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  32.63 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  24.78 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  29.32 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  30.38 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  27.33 
 
 
302 aa  77  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  31.79 
 
 
686 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  29.15 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.72 
 
 
1002 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  31.52 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  29.39 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  29.48 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  31.36 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  32.79 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  28.85 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  28.9 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  28.42 
 
 
1678 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  27.27 
 
 
554 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  25.45 
 
 
315 aa  53.1  0.000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  29.72 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  26.15 
 
 
714 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  26.39 
 
 
342 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  25.53 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  37.5 
 
 
615 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  24.02 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  27.43 
 
 
277 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  25 
 
 
446 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  25.13 
 
 
363 aa  46.6  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  37.33 
 
 
2272 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 
350 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>