70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2292 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0548  patatin  94.19 
 
 		 344 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  100 
 
 		 344 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  47.6 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  43.43 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  37.5 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  37.5 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  37.5 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  35.67 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  32.7 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  37.6 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  36.59 
 
 		 308 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  31.67 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  37.45 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  29.62 
 
 		 337 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  37.82 
 
 		 367 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  30.84 
 
 		 366 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  29.97 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  30.07 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  34.44 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  28.85 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  33.94 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  30.65 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  30.18 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  31.29 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  31.23 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  34.62 
 
 		 363 aa  102  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  32.17 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  32.17 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  32.92 
 
 		 375 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  32.92 
 
 		 397 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  32.92 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  32.92 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  32.92 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  32.92 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  32.92 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  33.05 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  34.02 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1002 aa  92  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  30.04 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  27.95 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  30.19 
 
 		 554 aa  87.8  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  33.78 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  27.06 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  27.91 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  29.78 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  27.46 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  32.47 
 
 		 686 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  28.05 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  30.77 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.58 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  27.91 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  32.34 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  28.02 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  36.36 
 
 		 1678 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  27.83 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  25.67 
 
 		 714 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  26.26 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  26.3 
 
 		 1113 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  43.04 
 
 		 2272 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  25.1 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  37.08 
 
 		 615 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  22.88 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09241  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10408  normal  0.281158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  28.19 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  28.36 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  25.93 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  24.48 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  27.8 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  26.83 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  22.36 
 
 		 383 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>