207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0656 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0656  patatin  100 
 
 
373 aa  773    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  78.22 
 
 
424 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  78.22 
 
 
422 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  77.65 
 
 
422 aa  567  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  65.89 
 
 
357 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  65.89 
 
 
357 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  65.89 
 
 
357 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  65.89 
 
 
357 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  65.89 
 
 
357 aa  475  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  65.6 
 
 
357 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  65.6 
 
 
357 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  65.6 
 
 
357 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  65.6 
 
 
357 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  65.88 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  62.04 
 
 
357 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  62.32 
 
 
364 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  62.32 
 
 
357 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  62.32 
 
 
364 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  62.32 
 
 
364 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  42.05 
 
 
638 aa  252  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  41.96 
 
 
343 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  41.22 
 
 
345 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  40.94 
 
 
335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  40.94 
 
 
335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  39.53 
 
 
344 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  41.5 
 
 
378 aa  210  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  37.7 
 
 
372 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  37.7 
 
 
372 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  34.75 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  37.11 
 
 
383 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  36.91 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  36.75 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  37.09 
 
 
305 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  33.04 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  35.25 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  35.94 
 
 
290 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  35.84 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  44.62 
 
 
381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  33.56 
 
 
287 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  34.16 
 
 
290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  43.16 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  27.88 
 
 
285 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  27.89 
 
 
281 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  28.72 
 
 
282 aa  92.8  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  27.93 
 
 
289 aa  92.8  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  31.94 
 
 
281 aa  89.7  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  26.92 
 
 
284 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  25.87 
 
 
283 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  27.24 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  25.95 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  25.52 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  27.43 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  25.09 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  32.6 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  25.86 
 
 
293 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  26.17 
 
 
304 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  27.08 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  27.08 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  27.24 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  25.61 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.42 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  24.91 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  24.91 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  25.26 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  25.69 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  24.83 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  27.41 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  25.17 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  24.91 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  24.91 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  25.17 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  26.56 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  31.05 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  25.17 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  25.17 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  25.17 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  25.17 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  25.17 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  27.74 
 
 
296 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  23.22 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  24.83 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  23.22 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  24.48 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  26.39 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  25.37 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.37 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  25.63 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.15 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  26.69 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  25.77 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  27.06 
 
 
470 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  25 
 
 
316 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  29.51 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  26.12 
 
 
306 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  30.85 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  25.81 
 
 
347 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  26.56 
 
 
306 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  27.27 
 
 
314 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  25.25 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  24.9 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>