104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2385 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  100 
 
 		 335 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  97.31 
 
 		 335 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  74.85 
 
 		 372 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  73.65 
 
 		 380 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  74.02 
 
 		 372 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  74.24 
 
 		 372 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  75.16 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  73.77 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  70.07 
 
 		 415 aa  447  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  62.06 
 
 		 378 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  51.26 
 
 		 343 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  52.79 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  43.19 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  43.19 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  42.86 
 
 		 422 aa  228  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  41.41 
 
 		 638 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  40.94 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  39.8 
 
 		 357 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  39.47 
 
 		 364 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  39.23 
 
 		 364 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  39.47 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  39.47 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  37.42 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  37.42 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  37.1 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  37.42 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  37.42 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  37.1 
 
 		 357 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  37.1 
 
 		 357 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  37.05 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  37.1 
 
 		 357 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  38.11 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  34.14 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  34.14 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  31.18 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  32.44 
 
 		 290 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  30.06 
 
 		 381 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  31.77 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  39.02 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  30.56 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  27.1 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  26.3 
 
 		 284 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  26.06 
 
 		 284 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  25.97 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  25.97 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  25.97 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  26.06 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  25.97 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  25.85 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  25.85 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  25.51 
 
 		 284 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  25.85 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  28.06 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  28.76 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  28.43 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  27.63 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  28.43 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  26.84 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  27.22 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  27.22 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  28.25 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  27 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  26.9 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  27.02 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  26.01 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  27.02 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  24.91 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  28.43 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  24.91 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  24.91 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  24.91 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  24.91 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  30.66 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  26.45 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  24 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  28.16 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  22.79 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  26.91 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  25.7 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  27.45 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  26.8 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  22.89 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  27.63 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  26.11 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  27.44 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  23.1 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  26.14 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.76 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  24.27 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  25 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45660  predicted protein  26.16 
 
 		 593 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.912846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  21.77 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2927  patatin  21.7 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.224599  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  23.28 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  27.73 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  23.29 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  25.34 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  24.5 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  50 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  50 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>