56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2927 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2927  patatin  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.224599  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10458  hypothetical protein  60 
 
 		 301 aa  394  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  22.95 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  25.73 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  23.5 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  26.32 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  26.83 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  25.65 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  26.32 
 
 		 345 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  22.07 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  22.41 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  24.89 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  25.36 
 
 		 373 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  22.46 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  24.27 
 
 		 433 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  23.56 
 
 		 343 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  22.46 
 
 		 370 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  24.34 
 
 		 372 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  24.23 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.06 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  24.67 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  24.77 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  22.62 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  23.79 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  25.23 
 
 		 424 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  24.29 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  40 
 
 		 418 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  22.13 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  40 
 
 		 418 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  24.66 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  25.23 
 
 		 422 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  24.68 
 
 		 383 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  40 
 
 		 418 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  22.38 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  24.79 
 
 		 415 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  21.7 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  24.88 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  22.75 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  23.72 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  22.54 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  23.28 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  24.88 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  24.88 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  24.88 
 
 		 357 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  24.07 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  24.88 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  25.35 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  25 
 
 		 346 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  43.48 
 
 		 419 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  43.48 
 
 		 419 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  25.35 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  20.88 
 
 		 383 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  25.35 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  25.35 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  23.36 
 
 		 377 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  23.38 
 
 		 383 aa  42.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>