144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02679 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02679  Patatin  100 
 
 		 378 aa  782    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  64.06 
 
 		 415 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  60.12 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  60.42 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  59.82 
 
 		 372 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  60.12 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  64.33 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  59.4 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  62.38 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  62.06 
 
 		 335 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  53.79 
 
 		 345 aa  332  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  45.95 
 
 		 343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  41.84 
 
 		 638 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  40.71 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  40.71 
 
 		 424 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  40.38 
 
 		 422 aa  215  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  41.5 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  38.28 
 
 		 357 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  38.28 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  38.28 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  38.28 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  38.28 
 
 		 357 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  37.98 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  37.98 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  37.98 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  37.69 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  40 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  39.66 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  39.66 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  39.66 
 
 		 357 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  39.26 
 
 		 364 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  38.33 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  32.65 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  34.39 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  30.48 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  38.89 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  32.87 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  42.21 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  32.88 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  30.19 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  24.58 
 
 		 283 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  25.69 
 
 		 283 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  24.33 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  24.67 
 
 		 283 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  26.53 
 
 		 283 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  24.67 
 
 		 283 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  24.84 
 
 		 283 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  24.33 
 
 		 283 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  33.33 
 
 		 289 aa  93.2  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  25.54 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  24.82 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  34.56 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  24.46 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  34.56 
 
 		 290 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  32.35 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  24.46 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  32.84 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  32.84 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  24.46 
 
 		 284 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  24.46 
 
 		 284 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  24.46 
 
 		 284 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  24.46 
 
 		 284 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  24.46 
 
 		 284 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  32.35 
 
 		 293 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  34.1 
 
 		 290 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  28.69 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  25.96 
 
 		 285 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  30.1 
 
 		 281 aa  87.8  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  25.18 
 
 		 284 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  29.1 
 
 		 279 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  29.58 
 
 		 304 aa  86.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  26.94 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  27.76 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  30.84 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  28.3 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  28.08 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  26.19 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  29.41 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  30.39 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  27.96 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  22.57 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  24.44 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.4 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  23.21 
 
 		 282 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  26.34 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  27.23 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  28.29 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45660  predicted protein  23.31 
 
 		 593 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.912846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  31.13 
 
 		 320 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  24.62 
 
 		 290 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.56 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.57 
 
 		 293 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  26.58 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  28.19 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.81 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  26.51 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  26.73 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  46.94 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>