129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0935 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  100 
 
 		 314 aa  616  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  43.42 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45660  predicted protein  23.61 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.912846  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  24.44 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  27.27 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  26.16 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  29.11 
 
 		 638 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  29.33 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  29.2 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  31.84 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  29.33 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  31.84 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  31.84 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  31.84 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  29.33 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  29.33 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  29.33 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  31.84 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  31.84 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4675  Patatin  33.14 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.0114015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  27.14 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  31.84 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  31.84 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  22.22 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  27.14 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  27.14 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  32.16 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  24.5 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2256  Patatin  30.45 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  22.22 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  25.89 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14077  predicted protein  50.67 
 
 		 594 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  24.5 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  24.55 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  24.54 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  24.55 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  24.55 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  22.93 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  23.68 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  26.91 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  27.23 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  27.23 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  24.43 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  22.93 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  24.19 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  26.29 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  22.93 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  28.25 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  22.93 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  22.93 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  22.93 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  21.93 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  22.93 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  22.56 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  27.27 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  24.44 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  29.76 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  26.21 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  30.18 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  24.29 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  22.56 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  22.18 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  25.6 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  25.93 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  23.4 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.64 
 
 		 383 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  25 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  32.58 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  23.11 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  23.11 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  25.56 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  28.39 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  27.63 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  22.69 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  23.55 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  22.69 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  27.65 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  25.31 
 
 		 372 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2850  Patatin  20.98 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000110096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  30.26 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  24.14 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  25.31 
 
 		 372 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  21.82 
 
 		 283 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  28.69 
 
 		 419 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  26.87 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  26.7 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  27.44 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  25.26 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  24.08 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  22.22 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  25.96 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  26.67 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  22.39 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  26.67 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  28.09 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  21.74 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.64 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  24.9 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  28.02 
 
 		 382 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>