41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45660 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45660  predicted protein  100 
 
 
593 aa  1231    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.912846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  24.73 
 
 
307 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14077  predicted protein  23.51 
 
 
594 aa  83.2  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  23.61 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4675  Patatin  24.69 
 
 
302 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.0114015 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  23.66 
 
 
283 aa  54.3  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  23.66 
 
 
283 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  30.71 
 
 
289 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  23.77 
 
 
305 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  23.77 
 
 
306 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  22.37 
 
 
283 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  24.26 
 
 
284 aa  51.6  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  23.77 
 
 
305 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  22.54 
 
 
283 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  23.31 
 
 
378 aa  51.2  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  24.68 
 
 
638 aa  51.2  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  22.94 
 
 
283 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  28.99 
 
 
422 aa  50.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  28.99 
 
 
422 aa  50.8  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  28.99 
 
 
424 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  27.2 
 
 
282 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  22.3 
 
 
283 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  26.45 
 
 
312 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  21.84 
 
 
293 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  21.5 
 
 
293 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  25.71 
 
 
306 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  24.58 
 
 
301 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  25.43 
 
 
344 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  21.83 
 
 
283 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  26.16 
 
 
335 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  26.16 
 
 
335 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  22.94 
 
 
293 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  21.5 
 
 
289 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  25.36 
 
 
306 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  21.99 
 
 
308 aa  44.3  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  22.94 
 
 
293 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  41.51 
 
 
373 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  23.98 
 
 
289 aa  44.3  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  34.43 
 
 
304 aa  43.9  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  26.47 
 
 
290 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.445531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>