291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4525 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  597  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  92.28 
 
 		 290 aa  548  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  91.93 
 
 		 290 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  90.62 
 
 		 290 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  79.23 
 
 		 293 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  78.87 
 
 		 293 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  78.32 
 
 		 293 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  78.17 
 
 		 293 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  77.39 
 
 		 289 aa  454  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  65.14 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  43.46 
 
 		 284 aa  254  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  42.4 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  42.05 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  42.05 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  42.4 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  42.05 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  42.05 
 
 		 284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  42.05 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  42.05 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  42.05 
 
 		 284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  42.05 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  39.58 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  39.44 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  39.08 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  39.08 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  39.08 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  39.08 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  42.11 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  38.73 
 
 		 283 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  38.73 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  40.14 
 
 		 282 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  37.46 
 
 		 281 aa  209  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  37.82 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  36.71 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  36.62 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  34.16 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  34.16 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  33.46 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  35.21 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  34.29 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  34.85 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  34.31 
 
 		 240 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  32.51 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  31.1 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  28.42 
 
 		 285 aa  149  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.28 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  31.45 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  30.63 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  29.75 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  28.98 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  28.78 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.72 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  30.74 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  30.32 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2256  Patatin  29.35 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  29.02 
 
 		 357 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  28.32 
 
 		 357 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  28.32 
 
 		 357 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  28.32 
 
 		 357 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  27.96 
 
 		 357 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  27.96 
 
 		 357 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  27.96 
 
 		 357 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  27.96 
 
 		 357 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  27.74 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  27 
 
 		 335 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  27.96 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  32.49 
 
 		 345 aa  86.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  27.4 
 
 		 424 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  27.4 
 
 		 422 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  26.37 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  29.17 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  29.17 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  28.3 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  26.67 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  29.17 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  28.47 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  30.84 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  29.17 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  27.3 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  27.24 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  28.77 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  27.94 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  24.84 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  25.38 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  25 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.23 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  24.68 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  29.2 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  30.05 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  28.86 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  26.96 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  28.65 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  26.29 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  25.31 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  28.09 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  23.13 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  29.82 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  28.8 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.86 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  27.8 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>