267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1253 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1253  Patatin  100 
 
 		 304 aa  632  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  36.96 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  35.76 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  33.11 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  33.11 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  31.99 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  33.11 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  32.43 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  30.88 
 
 		 270 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  32.76 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  31.44 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  28.28 
 
 		 284 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  28.62 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  31.45 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  30.5 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  28.28 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  28.28 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  28.28 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  28.28 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  28.62 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  28.28 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  30.5 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  27.95 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  27.95 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  28.81 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  27.55 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  30.85 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  30.14 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  30.14 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  27.61 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  27.55 
 
 		 279 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  30.14 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  30.14 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  28.28 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  28.28 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  28.28 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  28.28 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  29.79 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  27.72 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  27.85 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  28.86 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  27.27 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  30.04 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  27.52 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  29.15 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.1 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  27 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  26.22 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  25.69 
 
 		 240 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  26.06 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  32.6 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  25.34 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  24.3 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.41 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  32.95 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  32.95 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  32.95 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  30.94 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  23.76 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  31.43 
 
 		 345 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  30.94 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  30.94 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  31.98 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  30.94 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  29.76 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  30.06 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  31.4 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  31.4 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  31.4 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  31.4 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  31.98 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  31.98 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  31.98 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  31.98 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  31.98 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  30.06 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  25.67 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  29.82 
 
 		 638 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  27.96 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2256  Patatin  25.9 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  28.72 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.92 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  27.87 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  28.43 
 
 		 728 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28.43 
 
 		 751 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  28.43 
 
 		 728 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  26.05 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  26.89 
 
 		 728 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  27.94 
 
 		 733 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  30.07 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  30.07 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  30.07 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  30.07 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  30.07 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  28.95 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  28.07 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  27.75 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  27.09 
 
 		 728 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  39.08 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  26.8 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>