273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2735 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2735  patatin  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  67.49 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  67.49 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  67.84 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  66.78 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  65.14 
 
 		 289 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  64.44 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  64.44 
 
 		 290 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  63.96 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  63.73 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  38.6 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  38.03 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  38.03 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  38.03 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  38.03 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  38.38 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  38.03 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  38.03 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  37.68 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  37.68 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  37.68 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  36.62 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  36.97 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  36.97 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  36.97 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  36.97 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  39.29 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  35.69 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  38.71 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  36.27 
 
 		 283 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  36.27 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  36.65 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  37.59 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  33.81 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  35.09 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  35.09 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  33.68 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  35.25 
 
 		 281 aa  172  9e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  32.6 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  33.33 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  33.47 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  33.21 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  32.26 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  30.96 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  31.94 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.43 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  31.44 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  31.51 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  29.75 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  29.39 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  29.07 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  29.09 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  28.98 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  29.52 
 
 		 290 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2256  Patatin  32.72 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  30.16 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  28.37 
 
 		 345 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  28.06 
 
 		 335 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  26.57 
 
 		 638 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  28.06 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1768  patatin  26.81 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.114347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2559  Patatin  27.05 
 
 		 372 aa  92.4  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00539059  hitchhiker  0.000000000253034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  27.24 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1730  patatin  26.75 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.220053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1725  patatin  27.27 
 
 		 380 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  30.73 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  29.58 
 
 		 378 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  31.46 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  31.46 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  31.46 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  27.51 
 
 		 415 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  31.46 
 
 		 357 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1591  patatin  26.88 
 
 		 383 aa  85.5  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  30.99 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  30.99 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  30.99 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.65 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  30.99 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  27.93 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  30.99 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  27.93 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  27.93 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  27.59 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  27.93 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  26.17 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  25.91 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  30.73 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  25.67 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  25.58 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  29.08 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  32.14 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  25.89 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  28.78 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  27.86 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  28.14 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  28.14 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  28.14 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  28.14 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  28.14 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  28.14 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>