113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3187 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  100 
 
 		 371 aa  741    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  100 
 
 		 371 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  100 
 
 		 371 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  82.95 
 
 		 308 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  40.07 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  36.45 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  38.15 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  37.5 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  39.62 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  36.54 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  42.24 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  38.29 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  33.01 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  34.65 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  35.88 
 
 		 333 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  36.56 
 
 		 324 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  35.27 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  37 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  32.43 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  24.04 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  27.52 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  34.16 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  28.92 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  28.92 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  32.18 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  31.62 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  27.56 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  30.27 
 
 		 686 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35 
 
 		 1002 aa  98.6  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  27.12 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  26.76 
 
 		 554 aa  92.8  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  28.74 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  32.17 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  32.17 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  32.17 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  31.92 
 
 		 375 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  31.78 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  31.78 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  31.78 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  32.91 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  32.91 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  30.43 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  32.48 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  26.44 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  26.45 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  26.09 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  33.62 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  31.19 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  28.19 
 
 		 1678 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  31.96 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  28.8 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  25.98 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  26.71 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  33.33 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  30.45 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  28.79 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  26.5 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  24.7 
 
 		 714 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  25.66 
 
 		 256 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  24.81 
 
 		 446 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  38.67 
 
 		 2272 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  22.91 
 
 		 250 aa  52.8  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  28.57 
 
 		 1113 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  26.34 
 
 		 275 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  34.02 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  28.74 
 
 		 332 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  29.03 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  25.74 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  28.14 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  31.85 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  26.89 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  25.64 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  27.83 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  30.77 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  29.81 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  29 
 
 		 923 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  27.61 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  34.65 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  30.23 
 
 		 950 aa  46.6  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  37.89 
 
 		 378 aa  46.2  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25.76 
 
 		 760 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  27.83 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  32.97 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  27.69 
 
 		 894 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  29.05 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  27.15 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  25.37 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  25.49 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  28.88 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  27.78 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  22.96 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  28.88 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  28.99 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  29.51 
 
 		 707 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  27.75 
 
 		 414 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  24.39 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  26.74 
 
 		 275 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  27.51 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  27.62 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>