62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1036 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1036  Patatin  100 
 
 		 337 aa  692    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  33.07 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  33.13 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  35.08 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  31.18 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  37 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  37 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  37 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  29.3 
 
 		 326 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  30.07 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  36.59 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  35.78 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  34.38 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  28.78 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  37 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  33.59 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  33.59 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  37 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  30.95 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  30.95 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  28.75 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  28.93 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  31.2 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  30.92 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  30.92 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  30.92 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  30.92 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  30.92 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1002 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  28.97 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  31.98 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  28.84 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  32.52 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  29.77 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  28.87 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  28.7 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  28.49 
 
 		 554 aa  95.9  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  26.59 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  28.63 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  29.12 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  27.49 
 
 		 365 aa  86.3  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  32.56 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  31.37 
 
 		 390 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  32.42 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  29.74 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  25.57 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  28.18 
 
 		 686 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  24.62 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  26.34 
 
 		 714 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  27.6 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  25.16 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  23.95 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  29.82 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  44.87 
 
 		 2272 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  27.6 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  22.13 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  26.92 
 
 		 1678 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  24.38 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  24.42 
 
 		 334 aa  46.2  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  35 
 
 		 615 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  38.33 
 
 		 1113 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>