59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3245 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  100 
 
 
374 aa  757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  30.85 
 
 
320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  28.53 
 
 
302 aa  105  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  27.71 
 
 
309 aa  96.3  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  27.39 
 
 
1002 aa  95.9  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  31.32 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  31.32 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  30.1 
 
 
312 aa  94  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  30.04 
 
 
363 aa  93.6  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  26.9 
 
 
686 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  25.27 
 
 
340 aa  93.2  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  30.22 
 
 
336 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  26.67 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  29.01 
 
 
326 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  26.61 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  26.61 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  28.57 
 
 
397 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  26.48 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  28.44 
 
 
375 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  26.48 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  31.89 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  26.48 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  30.4 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  28.57 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  30.21 
 
 
390 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  25.38 
 
 
554 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  26.11 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  26.79 
 
 
311 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  32.14 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  28.98 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  26.17 
 
 
714 aa  80.9  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  24.86 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  25.64 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  25.91 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  30.22 
 
 
1678 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  24.62 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  25.61 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  27.08 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  28.02 
 
 
344 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  22.54 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  28.77 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  27.63 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  28.85 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  26.4 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  26.4 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  26.4 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  23.63 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  24.93 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  27.92 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  26.87 
 
 
326 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  26.22 
 
 
446 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  23.38 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  24.57 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  26.84 
 
 
308 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  24.51 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  24.38 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  25.65 
 
 
2272 aa  57.4  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  26.64 
 
 
1113 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>