138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0749 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0749  patatin  100 
 
 		 326 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  39.48 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  33.21 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  33.01 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  31.53 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  34.36 
 
 		 354 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  32.29 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  31.5 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  31.5 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  31.5 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  33.33 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  29.47 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  29.81 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  28.33 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  28.98 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  27.74 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  28.63 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  29.86 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  29.64 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1002 aa  85.9  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  30.77 
 
 		 397 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  33.78 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  31.84 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  27.14 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  27.33 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  27.89 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  31.7 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  29.24 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  28.36 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  31.12 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  31.12 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  31.4 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  27.11 
 
 		 714 aa  73.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  25.81 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  26.32 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  27.27 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  28.4 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  25.57 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  26.4 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  31.74 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  26.87 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  32.22 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  26.2 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  24.74 
 
 		 760 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  27.65 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  25.08 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  26.71 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  27.9 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  25.27 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.49 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  24.75 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.97 
 
 		 763 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  27.21 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  25.2 
 
 		 257 aa  52.8  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  24.05 
 
 		 1678 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  28.57 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  28.39 
 
 		 777 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  29.61 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  27.27 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  24.1 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  23.39 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  24.78 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  26.5 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  23.98 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  29.27 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  23.45 
 
 		 343 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  25.33 
 
 		 355 aa  49.7  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  28.08 
 
 		 317 aa  49.3  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  27.98 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  28.23 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  32.68 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  26.55 
 
 		 667 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  22.44 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.82 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  29.95 
 
 		 950 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  23.96 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  23.79 
 
 		 740 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  25.12 
 
 		 776 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  25.56 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  27.35 
 
 		 382 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  25.12 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  27.85 
 
 		 923 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  22.9 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.72 
 
 		 256 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  25.26 
 
 		 771 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  22.9 
 
 		 252 aa  46.6  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  30.2 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  25.66 
 
 		 363 aa  46.2  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  23.1 
 
 		 707 aa  46.2  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  28.35 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  25.1 
 
 		 754 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27638  predicted protein  27.57 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  22.99 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>