64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4294 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4294  patatin  100 
 
 
382 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  37.82 
 
 
377 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  26.92 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  35.24 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.22 
 
 
1002 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  33.5 
 
 
366 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  35.47 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  30 
 
 
302 aa  94  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  26.86 
 
 
554 aa  90.9  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  30.33 
 
 
351 aa  89.4  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  30.08 
 
 
320 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  36.67 
 
 
326 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  30.89 
 
 
312 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  29.74 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  32.39 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  31.63 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  28.51 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  27.54 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  30.58 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  29.72 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  35.58 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  30.56 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  31.41 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  26.04 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  30.77 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  31.52 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  31.52 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  30.16 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  31.52 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  31.52 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  31.52 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  31.52 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  31.52 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  28.25 
 
 
1678 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  33.18 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  29.75 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  29.73 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  29.73 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  29.31 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  27.01 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  27.98 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  28.97 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  31.88 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  31.88 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  31.88 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  30.61 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  27.92 
 
 
374 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  29.91 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  31.66 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  44.71 
 
 
2272 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  30.97 
 
 
367 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  35.16 
 
 
615 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  41.67 
 
 
714 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  26.72 
 
 
340 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  27.21 
 
 
326 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  26.7 
 
 
376 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  24.34 
 
 
686 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  27.63 
 
 
1113 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  30.11 
 
 
393 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  43.33 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  27.19 
 
 
341 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  26.09 
 
 
294 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  30.05 
 
 
406 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>