84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0130 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0130  patatin  100 
 
 		 334 aa  695    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  35.61 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  35.12 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  30.89 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  32.92 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  29.25 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  31.64 
 
 		 686 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  32.17 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  29.69 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  27.19 
 
 		 363 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  28.2 
 
 		 365 aa  135  8e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  28.75 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  27.74 
 
 		 554 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1002 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  32.14 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  33.47 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  28.75 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  35.24 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  32.18 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  32.18 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  32.18 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  28.44 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  26.58 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  31.23 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  26.74 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  30.28 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  30.5 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  30.43 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  29.24 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  27.78 
 
 		 366 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  28.03 
 
 		 311 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  26.91 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  28.9 
 
 		 367 aa  92.8  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  28.03 
 
 		 333 aa  93.2  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  30.51 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  30.51 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  29.78 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  26.95 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  29.02 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  29.74 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  26.11 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  30.29 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  29.74 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  29.74 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  29.74 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  29.74 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  27.71 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  29.74 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  29.74 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  30.5 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  32.55 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  28.36 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  26.78 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  23.86 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  24.59 
 
 		 1678 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  26.6 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  26.7 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  25.65 
 
 		 275 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  28.5 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  25.34 
 
 		 350 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  34.09 
 
 		 2272 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  28.8 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  27.03 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  28.32 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  27.27 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.66 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  25.49 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  25.76 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  23.08 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  22.5 
 
 		 583 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  26.5 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  22.26 
 
 		 714 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  25.47 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  24.09 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  24.05 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  28 
 
 		 615 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  25.84 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  24.68 
 
 		 264 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  25.47 
 
 		 1113 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  24 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  24 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  25.89 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  26.26 
 
 		 283 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  24.22 
 
 		 584 aa  42.7  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>