173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1257 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  100 
 
 		 320 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  28.89 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  32.24 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  27.46 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  27.94 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  26.64 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  26.83 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  27.24 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  25.12 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  29.69 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  27.73 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  24.17 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1002 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  30.41 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  30.41 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  30.41 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.77 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  22.09 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  30.13 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  28.63 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30.54 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  31.02 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  30.54 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  30.54 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  30.54 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  25.77 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  25.41 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.54 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  30.48 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  26.48 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  28 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  29.95 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  29.95 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  29.95 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  27.31 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  22.45 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.41 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.67 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.56 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  26.51 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  25.65 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  26.28 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.56 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  28.51 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  23.38 
 
 		 374 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  23.95 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  27.65 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  26.75 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  39.02 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  28.04 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  30.37 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  27.14 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  28.57 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  27.92 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  32.97 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  23.3 
 
 		 554 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  27.13 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  23.64 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  28.95 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  28.95 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  34.33 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  55.1 
 
 		 1678 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  29.73 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25 
 
 		 760 aa  52.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  34.38 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  28.8 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  32.58 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  28.5 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  25.96 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  34.81 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  25.96 
 
 		 375 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  25.09 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  25.96 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  25.96 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  46.38 
 
 		 2272 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  30.81 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  26.58 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  27.47 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  28.7 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  27.47 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  42.11 
 
 		 735 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  28.57 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  22.18 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  22.18 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  29.65 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  22.18 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  38.81 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  23.37 
 
 		 686 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  33.33 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 748 aa  49.3  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  25.53 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  25.53 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  25.86 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  26.01 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  39.08 
 
 		 754 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  28.42 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  25.53 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  25.79 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 581 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  29.27 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>