73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4648 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  100 
 
 
320 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  45.7 
 
 
309 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  44.48 
 
 
686 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  39.24 
 
 
302 aa  218  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  38.35 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  35.69 
 
 
340 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  36.58 
 
 
365 aa  191  1e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  30.89 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  34.73 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  34.46 
 
 
356 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.31 
 
 
1002 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  31.95 
 
 
337 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  29.21 
 
 
315 aa  151  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  31.68 
 
 
554 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  32.82 
 
 
376 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  37.45 
 
 
344 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  36.21 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  30.85 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  33.54 
 
 
340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  31.38 
 
 
311 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  28.9 
 
 
390 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  35.24 
 
 
343 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  28.48 
 
 
333 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  32.5 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  27.36 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  27.36 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  27.36 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  33.05 
 
 
358 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  30 
 
 
329 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  28.97 
 
 
337 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  32.65 
 
 
354 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  32.84 
 
 
336 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  33.21 
 
 
336 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  33.21 
 
 
336 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  25.08 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  28.75 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  26.12 
 
 
366 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  25.54 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  28.75 
 
 
397 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  28.75 
 
 
375 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  28.44 
 
 
332 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  25.77 
 
 
1113 aa  92.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  28.44 
 
 
332 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  28.12 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  33.18 
 
 
324 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  28.44 
 
 
332 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  28.12 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.08 
 
 
382 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  30.04 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  25.8 
 
 
336 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  28.57 
 
 
351 aa  85.9  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  26.2 
 
 
2272 aa  85.1  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  25.14 
 
 
714 aa  83.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  26.65 
 
 
1678 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  29.58 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  26.81 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  25.57 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  25.27 
 
 
446 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  24.19 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  27.52 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  40.43 
 
 
615 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  24.38 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  22.81 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  25.12 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  25.12 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  25.12 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  25.12 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  24.38 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  21.99 
 
 
398 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  25.12 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  25.12 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  23.04 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>