46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4284 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4284  patatin  100 
 
 		 398 aa  793    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  50.94 
 
 		 403 aa  311  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  43.99 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  43.5 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  43.5 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  43.46 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  40.91 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  40 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  42.31 
 
 		 400 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  42.38 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  42.53 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  42.11 
 
 		 395 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  41.84 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  40.59 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  44.48 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  37.66 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  38.33 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  42.19 
 
 		 454 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  37.61 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  38.46 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  43.25 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  39.1 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  38.59 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  40.12 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  39.81 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  37.79 
 
 		 410 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  33.42 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  33.42 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  33.42 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  39.74 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  30.15 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  30.51 
 
 		 401 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  33.76 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  32.5 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  27.18 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  29.02 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  29.8 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  24.77 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  28.71 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  32.46 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.32 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  26.43 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  21.99 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 748 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  27.6 
 
 		 392 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  29.1 
 
 		 304 aa  42.7  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>