45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1962 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1962  patatin  100 
 
 		 403 aa  799    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  50.94 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  40.89 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  43.43 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  45.1 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  43.25 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  43.25 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  42.94 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  44.81 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  42.22 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  43.94 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  43.45 
 
 		 397 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  44.22 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  43 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  44.56 
 
 		 375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  41.52 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  40.61 
 
 		 393 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  38.96 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  39.52 
 
 		 434 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  39.12 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  40.68 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  39.26 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  39.02 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  39.74 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  34.03 
 
 		 410 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  39.2 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  37.91 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  37.91 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  37.91 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  38.56 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  33.04 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  33.04 
 
 		 401 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  34.21 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  27.15 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  27.64 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  29.38 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  29.7 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  29.7 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  26.82 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  29.03 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  31.44 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  31.18 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  28.35 
 
 		 308 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 584 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  28.02 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>