35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4658 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4658  patatin  100 
 
 		 438 aa  872    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  50.85 
 
 		 375 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  42.9 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  44.69 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  42.06 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  41.76 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  44.31 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  40.87 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  40.87 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  38.58 
 
 		 423 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  43.96 
 
 		 395 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  41.14 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  40.07 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  40.76 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  37.02 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  41.39 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  35.41 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  38.99 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  39.31 
 
 		 434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  38.68 
 
 		 437 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  41.99 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  35.26 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  38.89 
 
 		 396 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  35.83 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  36.69 
 
 		 389 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  36.96 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  34.03 
 
 		 409 aa  172  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  34.7 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  34.7 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  34.7 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  37.62 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  33.08 
 
 		 401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  32.28 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  31.98 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>