37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0368 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  98.25 
 
 		 401 aa  813    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  825    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  43.26 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  40.51 
 
 		 424 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  38.29 
 
 		 418 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  38.29 
 
 		 418 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  38.29 
 
 		 418 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  39.8 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  38.17 
 
 		 409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  37.88 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  41.88 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  35.14 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  41.05 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  38.73 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  35.77 
 
 		 396 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  37.31 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  39.01 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  40.62 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  40.62 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  37.57 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  36.63 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  32.73 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  31.79 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  33.83 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  35.67 
 
 		 396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  35.35 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  30.51 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  34.23 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  34.56 
 
 		 434 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  33.93 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  33.04 
 
 		 403 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  32.19 
 
 		 375 aa  146  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  34.2 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  26.85 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  28.06 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  25.98 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  29.65 
 
 		 308 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>