56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3783 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  829    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  53.79 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  43.93 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  43.08 
 
 		 411 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  41.52 
 
 		 406 aa  275  9e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  39.53 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  37.47 
 
 		 410 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  39.03 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  39.03 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  39.03 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  36.88 
 
 		 401 aa  246  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  36.88 
 
 		 401 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  42.11 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  39.43 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  42.77 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  41.88 
 
 		 409 aa  239  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  40 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  41.62 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  36.34 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  38.64 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  40.26 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  38.15 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  41.38 
 
 		 454 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  37.24 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  39.45 
 
 		 431 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  39.14 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  37.23 
 
 		 397 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  36.61 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  39.63 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  36.34 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  36.68 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  36.93 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  34.38 
 
 		 375 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  28.36 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  26.78 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  26.36 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  25.97 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  28.08 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.06 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  26.5 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  25.81 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  29.56 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  28.99 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  27.91 
 
 		 358 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  28.99 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  28.92 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  31.91 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  24.78 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  28.27 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  29.17 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  25.94 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  24.35 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  24.12 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  28 
 
 		 495 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  25.89 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  24.16 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>