33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1012 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1012  patatin  100 
 
 		 328 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  30.35 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  31.16 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  31.46 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  31.46 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  31.46 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  29.32 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  29.26 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  28.66 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  28.66 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  28.66 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  28.66 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  27.49 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  27.83 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  27.3 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  28.46 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  25.91 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  27.34 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  27.34 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  27.52 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  26.74 
 
 		 371 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  26.74 
 
 		 371 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  26.74 
 
 		 371 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  24.69 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  28.76 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  28.57 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  24.58 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  25.43 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  23.63 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  22.88 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1002 aa  43.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  25.09 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>