More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1401 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1401  patatin  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  47.83 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  47.43 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0273  patatin  46.9 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  36.6 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.28 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.3 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  30.04 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  29.87 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.83 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.54 
 
 		 346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.17 
 
 		 311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.54 
 
 		 346 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.64 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.31 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  30.4 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  29 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.68 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  29 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  29.57 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  36.69 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.69 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  29.92 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  27.63 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  32.02 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  32.02 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  31.28 
 
 		 358 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  35.11 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  31.14 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.97 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30.84 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  30.84 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  30.84 
 
 		 474 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.97 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.97 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  35.11 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  31.14 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  30.7 
 
 		 349 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  31.14 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.97 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.97 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.97 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  30.84 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  31.58 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.84 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  30.1 
 
 		 317 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  29.36 
 
 		 346 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  34.97 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  30.1 
 
 		 315 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  31.89 
 
 		 314 aa  97.1  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  30.6 
 
 		 348 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  31.82 
 
 		 301 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  28.33 
 
 		 345 aa  95.5  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  29.44 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.33 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  31.02 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  33.66 
 
 		 760 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  27.05 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  31.15 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  30.98 
 
 		 314 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.88 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  30.98 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  31.02 
 
 		 301 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  28.43 
 
 		 301 aa  92  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  28.35 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  30.99 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  27.55 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  29.35 
 
 		 323 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  29.26 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  30.2 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  28.28 
 
 		 304 aa  89.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  33.65 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  29.51 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  27.68 
 
 		 748 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  30.84 
 
 		 740 aa  88.6  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  31.75 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  29.44 
 
 		 753 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  28.34 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.15 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  26.92 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  30.65 
 
 		 335 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  29.1 
 
 		 345 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  32.26 
 
 		 287 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  30.52 
 
 		 347 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  30.52 
 
 		 347 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  29.1 
 
 		 390 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  29.19 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.27 
 
 		 275 aa  85.5  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  28.57 
 
 		 343 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  29.89 
 
 		 327 aa  85.9  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  28.21 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  29.41 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  25.19 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  27.75 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  32.23 
 
 		 735 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>