More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0273 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0273  patatin  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  46.39 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  42.57 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  42.17 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  35.96 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  31.7 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  31.7 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  30.94 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.74 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.96 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.43 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.59 
 
 		 330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.36 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.63 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.63 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.82 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.98 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.51 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  31.98 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.98 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.98 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.98 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  31.25 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.98 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.98 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  33.48 
 
 		 345 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.8 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  33.04 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  32.76 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  33.48 
 
 		 349 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  29.33 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  28.7 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  28.85 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  32.16 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  34.3 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  32.59 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  32.18 
 
 		 760 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  32.59 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  31.07 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  32.59 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.19 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  32.59 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  30.94 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  25.68 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  32.42 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  29.91 
 
 		 298 aa  98.6  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  31.28 
 
 		 346 aa  98.6  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  28.57 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  33.91 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  34.86 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  32.14 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  34.85 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  33.72 
 
 		 310 aa  96.3  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  29.07 
 
 		 317 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  34.25 
 
 		 335 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  29.51 
 
 		 323 aa  95.9  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  35.43 
 
 		 330 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.74 
 
 		 347 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.18 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  30.94 
 
 		 324 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.39 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  32.16 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  28.8 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  30.94 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.74 
 
 		 347 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.74 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  29.74 
 
 		 474 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  29.31 
 
 		 358 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  32.47 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.74 
 
 		 347 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  29.83 
 
 		 322 aa  92.4  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  27.61 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.14 
 
 		 358 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  31.32 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.6 
 
 		 741 aa  91.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  29.28 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  30.77 
 
 		 740 aa  91.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.15 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  31.72 
 
 		 343 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  28.18 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.65 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  31.49 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  30.36 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  30.36 
 
 		 317 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  30.88 
 
 		 740 aa  89.4  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  27.69 
 
 		 314 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  25.39 
 
 		 304 aa  89  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.86 
 
 		 320 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  32.14 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  29.83 
 
 		 323 aa  88.6  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.86 
 
 		 320 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  30.7 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  30.52 
 
 		 737 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.38 
 
 		 333 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  32.26 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  23.95 
 
 		 738 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  30.6 
 
 		 347 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  32.97 
 
 		 354 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  32.93 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>