More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0216 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  99.6 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  47.43 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0273  patatin  42.97 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  37.84 
 
 		 266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.3 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.6 
 
 		 330 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.81 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.6 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  32.31 
 
 		 345 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  33.18 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  31.44 
 
 		 308 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.74 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  30.23 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  31.14 
 
 		 358 aa  95.9  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.52 
 
 		 346 aa  95.9  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.52 
 
 		 346 aa  95.5  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  29.46 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  29.46 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  29.46 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  29.46 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.46 
 
 		 347 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.46 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  29.91 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.46 
 
 		 347 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  29.46 
 
 		 474 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  29.46 
 
 		 302 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  31.58 
 
 		 348 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  31.14 
 
 		 358 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  30.91 
 
 		 303 aa  92  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  29.52 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  29.07 
 
 		 302 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  32.22 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  28.57 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  31.5 
 
 		 301 aa  89  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.06 
 
 		 315 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  27.48 
 
 		 317 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.96 
 
 		 293 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  29.77 
 
 		 314 aa  87  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  29 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  28.88 
 
 		 311 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.87 
 
 		 760 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  28.76 
 
 		 298 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  30.4 
 
 		 346 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  30.85 
 
 		 343 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  30.6 
 
 		 354 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  28.89 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  28.99 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  31.15 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  28.99 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  32.22 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  25.97 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  30.73 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  31.15 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  30.19 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  28.76 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  30.17 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  32.83 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  30.5 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  29.18 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  31.58 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  27.88 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  31.11 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  31.11 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  31.11 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  31.02 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  31.11 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  31.11 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  31.11 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  29.79 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  31.11 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  28.93 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  31.11 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.22 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  32.28 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  31.11 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  31.61 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  30.17 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  30.32 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  29.21 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  27.35 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  31.44 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.39 
 
 		 741 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  28.81 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  31.52 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  28.05 
 
 		 771 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  27.59 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.51 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  29.29 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  27.92 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  26.62 
 
 		 776 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  26.79 
 
 		 737 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>