28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1869 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  100 
 
 		 296 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  64.98 
 
 		 331 aa  348  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  57.23 
 
 		 330 aa  311  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  57.24 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  39.29 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  44.44 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  35.14 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  35.64 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  35.64 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  35.64 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  35.74 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  35.59 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  40.72 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  36.07 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  33.56 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  36.22 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  36.44 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  34.43 
 
 		 271 aa  92.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  26.82 
 
 		 368 aa  86.7  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  31.39 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  29.91 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  40.74 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  28.27 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  29 
 
 		 394 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  28.75 
 
 		 331 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  29.8 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  29.61 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  28.07 
 
 		 405 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>