70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3556 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  100 
 
 
331 aa  621  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  36.93 
 
 
351 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  36.06 
 
 
411 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  32.89 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  28.48 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  34.8 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  31.52 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  32.23 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  44.19 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  26.82 
 
 
398 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  27.8 
 
 
424 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  30.73 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  31.4 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  30.22 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  29.13 
 
 
420 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  48.15 
 
 
346 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  31.6 
 
 
288 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  48.15 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  30.8 
 
 
397 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  42.03 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  44.26 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  48.33 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  30.28 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  44.07 
 
 
306 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  44.07 
 
 
349 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  30.39 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  44.07 
 
 
305 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  44.07 
 
 
305 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  30.39 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  30.28 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  30.77 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  33.6 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  29.44 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  44.07 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  44.07 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  30.28 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  44.83 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  44.83 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  39.47 
 
 
301 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  43.1 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  44.83 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  44.83 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  44.83 
 
 
474 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  44.83 
 
 
347 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  44.83 
 
 
347 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  48.33 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  31.76 
 
 
294 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  39.34 
 
 
348 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.06 
 
 
323 aa  49.3  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  44.64 
 
 
345 aa  49.3  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  39.34 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  44.83 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  42.86 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  30.34 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  28.16 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  38.46 
 
 
216 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.7 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  26.87 
 
 
411 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  37.7 
 
 
346 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  44.83 
 
 
358 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  26.49 
 
 
288 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  29.55 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  36.28 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  40.62 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  40.91 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  40 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  35.44 
 
 
291 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  27.85 
 
 
263 aa  42.7  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  40.91 
 
 
223 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  33.33 
 
 
327 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>