200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0488 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 397 aa  785    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  54.5 
 
 		 420 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  49.05 
 
 		 413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  36.41 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  36.44 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  35.48 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  37.47 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  35.75 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  27.9 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  32.93 
 
 		 283 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  28.32 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.37 
 
 		 767 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  26.3 
 
 		 748 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  29.46 
 
 		 753 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  28.63 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.59 
 
 		 727 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  25.61 
 
 		 751 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  28.9 
 
 		 852 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  43.59 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.36 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  39.29 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  26.36 
 
 		 720 aa  59.7  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  30.48 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  29.1 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  30.77 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  29.08 
 
 		 920 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  30.86 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  28 
 
 		 667 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  30.77 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  29.41 
 
 		 813 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  29.1 
 
 		 945 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  29.75 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  30.71 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  26.16 
 
 		 733 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  38.75 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  26.42 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  26.51 
 
 		 728 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  29.08 
 
 		 930 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  28.68 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  26.8 
 
 		 751 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  29.57 
 
 		 707 aa  57.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30 
 
 		 796 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  30 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  27.09 
 
 		 736 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  34.29 
 
 		 714 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  31.54 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  29.46 
 
 		 804 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  31.54 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  28 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  26.51 
 
 		 728 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  29.84 
 
 		 798 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  23.84 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  27.49 
 
 		 738 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  27.49 
 
 		 739 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  29.37 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  27.25 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26.55 
 
 		 741 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  34.62 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  28.17 
 
 		 738 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  29.67 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  29.67 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  27.49 
 
 		 738 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  29.67 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  38.75 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  40 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  29.16 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  29.16 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  27.93 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  31.67 
 
 		 288 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  27.54 
 
 		 318 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  25.32 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  27.97 
 
 		 318 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  28.95 
 
 		 317 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  28.62 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  28.12 
 
 		 298 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  26.89 
 
 		 728 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  25.1 
 
 		 740 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  27.41 
 
 		 267 aa  53.1  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  30.45 
 
 		 349 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  27.21 
 
 		 737 aa  53.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  26.03 
 
 		 275 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  29.16 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  27.39 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  31.45 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  30.13 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  28.15 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  25.51 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  27.98 
 
 		 777 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  25.11 
 
 		 733 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  30.13 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  28.69 
 
 		 734 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  30.13 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  25.94 
 
 		 735 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  30.48 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  31.6 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  30.97 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  30.64 
 
 		 265 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  28.63 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.64 
 
 		 256 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  27.35 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>