85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_51530  ExoU  100 
 
 		 687 aa  1384    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167383  hitchhiker  0.000105618 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2888  hypothetical protein  28.38 
 
 		 615 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  27.52 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  28.86 
 
 		 579 aa  77  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  28.52 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  25.56 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  22.92 
 
 		 661 aa  63.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  28.08 
 
 		 586 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  23.06 
 
 		 665 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  26.49 
 
 		 883 aa  60.8  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  26.12 
 
 		 883 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  26.59 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  35.62 
 
 		 339 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  26.02 
 
 		 321 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  25.61 
 
 		 321 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  26.32 
 
 		 321 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  26.32 
 
 		 294 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  25.61 
 
 		 321 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  25.61 
 
 		 321 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  25.61 
 
 		 321 aa  55.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  25.61 
 
 		 321 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  25.61 
 
 		 321 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  25.61 
 
 		 321 aa  55.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  26.91 
 
 		 339 aa  54.3  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  25.79 
 
 		 728 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  46.67 
 
 		 282 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  25.38 
 
 		 740 aa  52.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  42.65 
 
 		 775 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  37.5 
 
 		 311 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.89 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.89 
 
 		 728 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.56 
 
 		 760 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  37.04 
 
 		 740 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  38.16 
 
 		 746 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  40.91 
 
 		 751 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  47.06 
 
 		 420 aa  48.5  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  35 
 
 		 293 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  40.91 
 
 		 727 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  42.19 
 
 		 728 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  44.23 
 
 		 293 aa  47.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  49.15 
 
 		 377 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  38.75 
 
 		 301 aa  47.8  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  26.81 
 
 		 341 aa  47.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  35 
 
 		 284 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  33.98 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  42.42 
 
 		 738 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  44.26 
 
 		 777 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  45.76 
 
 		 377 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  41.25 
 
 		 319 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  40.54 
 
 		 316 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  44.07 
 
 		 375 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  46.43 
 
 		 263 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  37.84 
 
 		 358 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  35.35 
 
 		 343 aa  46.6  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  31.72 
 
 		 790 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  40.54 
 
 		 318 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  46.3 
 
 		 252 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  47.06 
 
 		 251 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  39.39 
 
 		 733 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  36.14 
 
 		 346 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  36.14 
 
 		 346 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  35.24 
 
 		 753 aa  45.8  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  36.71 
 
 		 358 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0488  patatin  33.73 
 
 		 313 aa  45.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  28.69 
 
 		 394 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  35 
 
 		 306 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  35 
 
 		 305 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  32.5 
 
 		 280 aa  44.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  35 
 
 		 305 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  33.7 
 
 		 520 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  42.27 
 
 		 303 aa  44.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2826  patatin-like phospholipase family protein  39.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  46.43 
 
 		 796 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  35.14 
 
 		 302 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  32.67 
 
 		 767 aa  44.3  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6376  patatin  41.79 
 
 		 444 aa  44.3  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  39.19 
 
 		 315 aa  44.3  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  37.1 
 
 		 406 aa  44.3  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  32.11 
 
 		 736 aa  43.9  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  36.49 
 
 		 306 aa  44.3  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  50.94 
 
 		 748 aa  44.3  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  36.62 
 
 		 734 aa  43.9  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  25.4 
 
 		 345 aa  43.9  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  28.57 
 
 		 363 aa  43.9  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  39.19 
 
 		 317 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>