208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6376 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6376  patatin  100 
 
 		 444 aa  850    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  25.11 
 
 		 520 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  26.79 
 
 		 665 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  26.04 
 
 		 661 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2888  hypothetical protein  26.98 
 
 		 615 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  23.8 
 
 		 760 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  26.17 
 
 		 579 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  27.52 
 
 		 707 aa  68.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  32.43 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  24.75 
 
 		 579 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  27.54 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  40.79 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  39.36 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  43.24 
 
 		 740 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  40.48 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  40.48 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  40.48 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  40.48 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  40.48 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  40.48 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  39.29 
 
 		 321 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  29.85 
 
 		 753 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  40.48 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  59.18 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  48.44 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  38.1 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  41.89 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  51.92 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  59.18 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  49.18 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  59.18 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  59.18 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  59.18 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  59.18 
 
 		 306 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  59.18 
 
 		 358 aa  57  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  57.14 
 
 		 302 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  57.14 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  35.25 
 
 		 798 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  50 
 
 		 751 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  57.14 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  50 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  57.14 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  57.14 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  48.08 
 
 		 733 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  50 
 
 		 728 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  45.31 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  35.25 
 
 		 796 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  28.12 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  40.28 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  41.54 
 
 		 775 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  36 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  51.92 
 
 		 813 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  45.76 
 
 		 319 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  50 
 
 		 803 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  50 
 
 		 803 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  50 
 
 		 803 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  28.06 
 
 		 312 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  47.62 
 
 		 734 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  51.72 
 
 		 349 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  46.15 
 
 		 900 aa  53.5  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  53.19 
 
 		 746 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  46.55 
 
 		 317 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  46.55 
 
 		 315 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  42.31 
 
 		 909 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  46.55 
 
 		 738 aa  53.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  41.38 
 
 		 275 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  50 
 
 		 736 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50 
 
 		 748 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  40.74 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  47.92 
 
 		 728 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  52.08 
 
 		 728 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  43.08 
 
 		 933 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  39.42 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  43.08 
 
 		 920 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  41.38 
 
 		 275 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  40.91 
 
 		 754 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  46.15 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  46.15 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  43.08 
 
 		 945 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  43.08 
 
 		 930 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  43.08 
 
 		 728 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  41.67 
 
 		 737 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  35.37 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  45.83 
 
 		 728 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  38.38 
 
 		 320 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  48.08 
 
 		 738 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  48.08 
 
 		 804 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  48.08 
 
 		 738 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  38.81 
 
 		 741 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  44.9 
 
 		 720 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  40.91 
 
 		 275 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  48.08 
 
 		 737 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1022  patatin-like phospholipase family protein  42.86 
 
 		 285 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  48.08 
 
 		 738 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  47.92 
 
 		 358 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  48.08 
 
 		 767 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  34.03 
 
 		 316 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  45.28 
 
 		 293 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  45 
 
 		 750 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>