194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0636 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0636  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0411  cyclic nucleotide-binding protein  83.49 
 
 		 209 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0419  cyclic nucleotide-binding protein  83.49 
 
 		 209 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1689  cyclic nucleotide-binding protein  69.19 
 
 		 212 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0277  cyclic nucleotide-binding protein  68.72 
 
 		 210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1067  cyclic nucleotide-binding protein  61.24 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3761  cAMP-binding domain-containing protein  49.41 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.074854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  30.33 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  30.33 
 
 		 158 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  29.51 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  33.05 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.82 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.51 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  32.2 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.48 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0234  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.66 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 598 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.97 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  23.94 
 
 		 322 aa  58.2  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.36 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.29 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25.36 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.56 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 		 581 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.21 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.76 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.18 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  29.36 
 
 		 157 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  31.18 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 		 577 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0173  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.106244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 154 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0116  cyclic nucleotide-binding protein  31.37 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 		 583 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.78 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.25 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  34.91 
 
 		 165 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 		 154 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  23.14 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.89 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  26.89 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  26.89 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  26.89 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  26.89 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  26.89 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  26.89 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  26.67 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  26.05 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.3 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.07 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  26.05 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  26.05 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  26.05 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  26.05 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1957  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2741  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  26.17 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.84 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  26.05 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>