More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0296 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 624 aa  1238    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  43.43 
 
 		 624 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  39.87 
 
 		 620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  40.1 
 
 		 613 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  41.54 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  39.83 
 
 		 608 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  52.65 
 
 		 343 aa  339  9e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  52.32 
 
 		 334 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  53.16 
 
 		 318 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  52.98 
 
 		 331 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  52.32 
 
 		 343 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  45.58 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  46.33 
 
 		 425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  42.18 
 
 		 483 aa  320  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  48.68 
 
 		 343 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  45.16 
 
 		 422 aa  310  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  50.99 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  46.74 
 
 		 645 aa  295  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  51.23 
 
 		 331 aa  290  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  46.69 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  45.99 
 
 		 305 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  45.99 
 
 		 305 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  48.23 
 
 		 338 aa  273  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  43.37 
 
 		 311 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  46.73 
 
 		 332 aa  263  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  47.08 
 
 		 306 aa  259  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  43.14 
 
 		 310 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  43.14 
 
 		 310 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  43.14 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  252  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  252  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  42.81 
 
 		 310 aa  252  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  42.81 
 
 		 310 aa  252  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  42.48 
 
 		 310 aa  252  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  42.48 
 
 		 330 aa  245  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  43.38 
 
 		 335 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  43.38 
 
 		 335 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  43.38 
 
 		 335 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  41.38 
 
 		 313 aa  244  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  47.37 
 
 		 317 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  40.07 
 
 		 307 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  41.89 
 
 		 308 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  42.49 
 
 		 331 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  45 
 
 		 346 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  40.14 
 
 		 309 aa  228  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  42.11 
 
 		 333 aa  226  7e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  44.52 
 
 		 308 aa  226  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  40.64 
 
 		 309 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  40.14 
 
 		 309 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  43.88 
 
 		 315 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  43 
 
 		 306 aa  226  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  38.85 
 
 		 326 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  38.91 
 
 		 307 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  38.85 
 
 		 326 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  40.49 
 
 		 309 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  40.49 
 
 		 309 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  40.49 
 
 		 309 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  40.49 
 
 		 309 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  40.49 
 
 		 309 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  39.25 
 
 		 307 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  40.14 
 
 		 309 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  40.28 
 
 		 309 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  42.11 
 
 		 434 aa  224  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  38.18 
 
 		 326 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  38.18 
 
 		 326 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  44.84 
 
 		 347 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  38.18 
 
 		 326 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  38.18 
 
 		 326 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  44.01 
 
 		 304 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  38.18 
 
 		 326 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  38.18 
 
 		 326 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  39.93 
 
 		 309 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  45.1 
 
 		 309 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  44.77 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  45.1 
 
 		 309 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  38.54 
 
 		 310 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  43.79 
 
 		 311 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  43.82 
 
 		 304 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  43.82 
 
 		 304 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  41.72 
 
 		 304 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  43.66 
 
 		 304 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  43.46 
 
 		 304 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  44.3 
 
 		 309 aa  216  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  43.46 
 
 		 333 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  42 
 
 		 304 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  43.51 
 
 		 304 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  42.96 
 
 		 304 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  43.11 
 
 		 304 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  42.39 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  45.55 
 
 		 309 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  38.14 
 
 		 307 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  44.56 
 
 		 311 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0299  L-glutaminase  40.93 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0584671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>