178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4729 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  100 
 
 		 311 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  46.91 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  47.59 
 
 		 313 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  48.01 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  48.01 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  48.01 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  47.56 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  48.34 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  48.34 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  48.01 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  48.01 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  47.68 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  48.01 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  51.32 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  44.63 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  44.63 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  44.63 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  44.63 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  42.07 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  43.42 
 
 		 624 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  43.37 
 
 		 624 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  43.38 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  44.37 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  41.25 
 
 		 601 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  41.06 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  41.99 
 
 		 613 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  40.73 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  41 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  38.83 
 
 		 331 aa  238  6.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  41.56 
 
 		 412 aa  235  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  40.94 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  41.98 
 
 		 483 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  40.91 
 
 		 620 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  42.31 
 
 		 608 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  39.74 
 
 		 418 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  40.13 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  40.07 
 
 		 422 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  37.83 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  37.83 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  38.11 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  40.2 
 
 		 307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  40.83 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  36.42 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  40.98 
 
 		 331 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  39.54 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  38.69 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  36.59 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  37.05 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  40 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  38.76 
 
 		 309 aa  208  9e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  37.46 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  37.29 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  37.13 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1183  glutaminase  37.79 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000358411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1254  glutaminase  37.79 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000302254  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1184  glutaminase  37.79 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000737214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  39.65 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  39.65 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  38.64 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  37.7 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  40.7 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  38.81 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  39.72 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  38.95 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  36.36 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  37.13 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  39.86 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  37.46 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  38.44 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  36.07 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  37.42 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2487  glutaminase  39.4 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.702442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  36.62 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  37.42 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  37.54 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  36.72 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  36.46 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  37.54 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  39.65 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  37.46 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  38.46 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  36.45 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  33.78 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  37.09 
 
 		 304 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  36.93 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  33.78 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  40.89 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  33.45 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  33.45 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  33.45 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  36.39 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1111  glutaminase  40 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000036158  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  35.76 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  33.45 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  36.07 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  37.24 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  38.36 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  33.45 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  37.19 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  33.45 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>