178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  100 
 
 
347 aa  706    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  47.59 
 
 
422 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  45.54 
 
 
418 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  44.48 
 
 
601 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  41.78 
 
 
343 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  41.78 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  45.91 
 
 
425 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
613 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  42.76 
 
 
624 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  43.06 
 
 
608 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  41.49 
 
 
331 aa  226  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  41.55 
 
 
318 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  41.4 
 
 
334 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  44.84 
 
 
624 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  44.14 
 
 
456 aa  223  6e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  43.97 
 
 
620 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  42.91 
 
 
412 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  42.31 
 
 
343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  41.52 
 
 
483 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  45.07 
 
 
331 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  39.93 
 
 
306 aa  192  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  40.58 
 
 
645 aa  192  9e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  37.68 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  37.68 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  39.31 
 
 
434 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  40.77 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  36.3 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  39.78 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  38.55 
 
 
304 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  40 
 
 
315 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  39.27 
 
 
304 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  36.26 
 
 
308 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  38.91 
 
 
304 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  38.91 
 
 
304 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  38.91 
 
 
304 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  36.57 
 
 
306 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  36.26 
 
 
308 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  38.71 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  38.55 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  39.57 
 
 
304 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  34.98 
 
 
316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  35.61 
 
 
307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  35.15 
 
 
333 aa  165  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  34.88 
 
 
310 aa  165  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  34.88 
 
 
310 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4564  glutaminase  37 
 
 
306 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  32.86 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  32.86 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  38.55 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  33.92 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  35.88 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  32.5 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  32.5 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  37.72 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  32.5 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  38.91 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  34.52 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  32.5 
 
 
326 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  32.14 
 
 
326 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  32.14 
 
 
326 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  34.16 
 
 
310 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  34.16 
 
 
310 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  34.16 
 
 
310 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  38.41 
 
 
308 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  34.16 
 
 
310 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  34.16 
 
 
310 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  34.16 
 
 
310 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  33.92 
 
 
306 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1697  glutaminase  34.97 
 
 
308 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1638  glutaminase  34.97 
 
 
308 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1630  glutaminase  34.97 
 
 
308 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  33.56 
 
 
308 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  33.33 
 
 
309 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1810  glutaminase  34.62 
 
 
308 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  35.97 
 
 
308 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  33.56 
 
 
308 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  33.56 
 
 
308 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  36.54 
 
 
317 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  33.56 
 
 
308 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  37.01 
 
 
346 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  33.56 
 
 
308 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1645  glutaminase  34.62 
 
 
308 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00641427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  33.56 
 
 
308 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  33.56 
 
 
308 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  33.56 
 
 
308 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  33.56 
 
 
308 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  35.9 
 
 
331 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  37.01 
 
 
304 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  37.01 
 
 
304 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  35.82 
 
 
303 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  37.01 
 
 
304 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2695  glutaminase  33.45 
 
 
304 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  36.19 
 
 
302 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  37.01 
 
 
304 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  37.01 
 
 
304 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  37.01 
 
 
304 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  36.19 
 
 
306 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  32.88 
 
 
304 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  32.22 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  31.52 
 
 
313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>