178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1222 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1322  glutaminase  90.79 
 
 		 304 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.152397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  84.21 
 
 		 304 aa  534  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  83.22 
 
 		 304 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1183  glutaminase  84.54 
 
 		 304 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000358411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1254  glutaminase  84.54 
 
 		 304 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000302254  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1184  glutaminase  84.54 
 
 		 304 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000737214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1111  glutaminase  83.88 
 
 		 304 aa  531  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000036158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  83.55 
 
 		 304 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  83.55 
 
 		 304 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  83.22 
 
 		 304 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  83.22 
 
 		 304 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2697  glutaminase  82.57 
 
 		 304 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.718556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2695  glutaminase  80.92 
 
 		 304 aa  517  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2870  glutaminase  80.92 
 
 		 304 aa  517  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2487  glutaminase  78.95 
 
 		 304 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.702442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  66.45 
 
 		 306 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  65.89 
 
 		 307 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  66.34 
 
 		 308 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  65.13 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  66.34 
 
 		 308 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  66.34 
 
 		 308 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  64.8 
 
 		 306 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  65.79 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  60.07 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1638  glutaminase  60.73 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  60.07 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1630  glutaminase  60.73 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.637067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1645  glutaminase  60.73 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00641427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  60.07 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  60.07 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1697  glutaminase  60.73 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  60.07 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  60.07 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  60.07 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  59.74 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  59.74 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1810  glutaminase  60.4 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  63.58 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  63.25 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2007  glutaminase  62.33 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  62.25 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2292  glutaminase  59.93 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0498348  decreased coverage  0.0000324531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3197  glutaminase  59.6 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0628801  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  59.33 
 
 		 302 aa  361  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0139  glutaminase  62.91 
 
 		 302 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3373  glutaminase  61.92 
 
 		 302 aa  353  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1741  L-glutaminase  56.07 
 
 		 304 aa  346  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01329  glutaminase  56.81 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  51.8 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  51.48 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  51.48 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  51.48 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  51.15 
 
 		 304 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  50.82 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  51.61 
 
 		 308 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  50.82 
 
 		 333 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  49.51 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  49.51 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  49.51 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  49.51 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  49.5 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  49.34 
 
 		 346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  49.18 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  49.18 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3965  Glutaminase  48.83 
 
 		 306 aa  301  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  48.52 
 
 		 304 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  49.51 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  49.51 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  49.51 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  49.18 
 
 		 309 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  49.18 
 
 		 309 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  50.49 
 
 		 315 aa  292  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  51.47 
 
 		 311 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  51.14 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  51.14 
 
 		 311 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  49.18 
 
 		 318 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  48.87 
 
 		 309 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  49.17 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09673  glutaminase  47.87 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  48.84 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  49.67 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  47.02 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  47.9 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  47.33 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  48.22 
 
 		 309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3548  L-glutaminase  46.75 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  48.22 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  46.89 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  48.22 
 
 		 309 aa  271  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4564  glutaminase  48.81 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0137  Glutaminase  47.92 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  44.84 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0977  Glutaminase  41.64 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4370  glutaminase  42.86 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0794447  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  42.52 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  42.21 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  39.47 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  39.47 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  38.11 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>