178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3760 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  100 
 
 		 332 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  54.13 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  54.13 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  54.13 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  57.27 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  55.66 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  55.08 
 
 		 331 aa  358  9e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  46.91 
 
 		 311 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  45.13 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  48.36 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  48.8 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  44.28 
 
 		 624 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  44.01 
 
 		 601 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  43.55 
 
 		 313 aa  271  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  46.73 
 
 		 624 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  44.41 
 
 		 310 aa  262  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  45.21 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  44.41 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  44.55 
 
 		 310 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  44.08 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  44.08 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  44.08 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  44.08 
 
 		 310 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  44.08 
 
 		 310 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  43.75 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  41.97 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  42.62 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  40.97 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  44.26 
 
 		 620 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  43.17 
 
 		 613 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  42.3 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  42.35 
 
 		 608 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  42.02 
 
 		 418 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  42.54 
 
 		 422 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  39.61 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  40.4 
 
 		 343 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  44.88 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  40.13 
 
 		 483 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  41.31 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  43.55 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  37.05 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  37.05 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  39.87 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  41.8 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  36.39 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  36.07 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  42.32 
 
 		 309 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  39.62 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  40.06 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  41.42 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  35.92 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  41.31 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  34.9 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  34.9 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  34.9 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  34.9 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  34.9 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  34.9 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  39.62 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  35.53 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  37.59 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  40.4 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  34.9 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  37.76 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  34.9 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  39.32 
 
 		 434 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  39.59 
 
 		 308 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  39.02 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  39.18 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  37.24 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  37.24 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  37.24 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43320  glutaminase  40.62 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.524936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  38.82 
 
 		 304 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  37.24 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  37.59 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  40.27 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  38.83 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  40.27 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  36.93 
 
 		 309 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  37.25 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  36.9 
 
 		 304 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  36.63 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  36.63 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  37.98 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3635  glutaminase  39.52 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  36.3 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  37.01 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  35.27 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  39.73 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  36.96 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  37.39 
 
 		 645 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  36.57 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  36.9 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  38.28 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  37.05 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  38.28 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  38.28 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  38.28 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  38.28 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>