178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1163 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  100 
 
 
331 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  59.38 
 
 
613 aa  329  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  51.27 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  54.42 
 
 
624 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  50.99 
 
 
334 aa  320  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  55.33 
 
 
620 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  50 
 
 
318 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  52.98 
 
 
425 aa  309  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  51.32 
 
 
343 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  51.32 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  51.23 
 
 
624 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  50.31 
 
 
483 aa  299  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  52.76 
 
 
412 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  48.12 
 
 
343 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  51 
 
 
422 aa  281  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  47.45 
 
 
608 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  49.82 
 
 
601 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  45.25 
 
 
305 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  45.25 
 
 
305 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  49.13 
 
 
418 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  46.56 
 
 
306 aa  259  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  47.44 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  45.72 
 
 
338 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  44.88 
 
 
332 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  44.52 
 
 
434 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  46.94 
 
 
456 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  40.98 
 
 
311 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  40.19 
 
 
335 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  40.19 
 
 
335 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  40.19 
 
 
335 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  45.07 
 
 
347 aa  229  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  40.38 
 
 
330 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  41.3 
 
 
307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  38.24 
 
 
326 aa  222  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  38.24 
 
 
326 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  38.67 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  38.67 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  38.67 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  38.67 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  38.67 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  38.67 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  40.61 
 
 
307 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  39.47 
 
 
307 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  35.67 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  40.94 
 
 
309 aa  212  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  41.56 
 
 
317 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  39.42 
 
 
315 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  41.56 
 
 
309 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  38.98 
 
 
331 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  42.43 
 
 
311 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  37.91 
 
 
308 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  38.08 
 
 
310 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  37.83 
 
 
309 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  36.66 
 
 
310 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  42.19 
 
 
311 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  41.53 
 
 
311 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  38.08 
 
 
310 aa  205  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  38.08 
 
 
310 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  38.08 
 
 
310 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  38.08 
 
 
310 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  38.08 
 
 
310 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  36.54 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  36.54 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  36.54 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  36.54 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  36.54 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  40.62 
 
 
304 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  41.25 
 
 
309 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  37.75 
 
 
310 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  36.54 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  42.52 
 
 
309 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  36.54 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  37.75 
 
 
310 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  38.08 
 
 
310 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  40.14 
 
 
307 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  36.54 
 
 
309 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  42.16 
 
 
309 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  36.21 
 
 
309 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  36.54 
 
 
309 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  36.86 
 
 
306 aa  202  9e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  42.16 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  38.81 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  37 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  35.76 
 
 
304 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  37.12 
 
 
309 aa  199  6e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  40.41 
 
 
304 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  37.67 
 
 
304 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  40.97 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  39.02 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  40.97 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  40.97 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3036  glutaminase  37.67 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103836  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  40.97 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  40.97 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  40.97 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  37.67 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  38.81 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0311  hypothetical protein  37.42 
 
 
310 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1328  glutaminase  37.33 
 
 
304 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00785417  hitchhiker  0.00333617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  41.46 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>