178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0038 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  100 
 
 
313 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  56.49 
 
 
317 aa  331  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  50.99 
 
 
310 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  50.99 
 
 
310 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  50.66 
 
 
310 aa  323  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  50.66 
 
 
310 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  50.66 
 
 
310 aa  322  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  50.66 
 
 
310 aa  322  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  50.99 
 
 
310 aa  322  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  50.99 
 
 
310 aa  322  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  50.33 
 
 
310 aa  322  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  50 
 
 
310 aa  315  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  47.59 
 
 
311 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  45.48 
 
 
330 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  43.55 
 
 
332 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  44.84 
 
 
335 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  44.84 
 
 
335 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  44.84 
 
 
335 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  43.23 
 
 
331 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  41.94 
 
 
338 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  41.38 
 
 
624 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  37.83 
 
 
624 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  39.02 
 
 
425 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  37.46 
 
 
318 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  36.42 
 
 
343 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  36.75 
 
 
334 aa  222  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  37.75 
 
 
601 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  37.82 
 
 
613 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  36.84 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  36.09 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  39.55 
 
 
412 aa  212  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  37.13 
 
 
306 aa  211  9e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  34.87 
 
 
608 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  36.39 
 
 
483 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  36.31 
 
 
315 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  36.72 
 
 
305 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  36.72 
 
 
305 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  36.91 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  33.44 
 
 
343 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  35.74 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  37.15 
 
 
422 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  35.35 
 
 
331 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  35.71 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  34.84 
 
 
309 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  35.53 
 
 
311 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  35.86 
 
 
311 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  37.85 
 
 
306 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  32.9 
 
 
333 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  36.21 
 
 
306 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  34.81 
 
 
309 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  36.49 
 
 
306 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  35.37 
 
 
304 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  35.37 
 
 
304 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  35.83 
 
 
307 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  35.37 
 
 
304 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  36.3 
 
 
311 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  36.11 
 
 
309 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  35.37 
 
 
304 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  35.37 
 
 
304 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  35.37 
 
 
304 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  36.11 
 
 
309 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1697  glutaminase  36.71 
 
 
308 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172096  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1630  glutaminase  36.71 
 
 
308 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  35.59 
 
 
304 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1810  glutaminase  36.71 
 
 
308 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  35.54 
 
 
304 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1638  glutaminase  36.71 
 
 
308 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1645  glutaminase  36.71 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00641427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  36.79 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  34.56 
 
 
418 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  33.01 
 
 
308 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  36.36 
 
 
307 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  35.07 
 
 
620 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  32.37 
 
 
308 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.00000034467 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  36.36 
 
 
307 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  34.31 
 
 
304 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  34.31 
 
 
304 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  34.49 
 
 
309 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  32.37 
 
 
308 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  35 
 
 
308 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  35.57 
 
 
304 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  35.54 
 
 
456 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  35.57 
 
 
333 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  35 
 
 
308 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  35.27 
 
 
306 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  36.84 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  35 
 
 
308 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  35 
 
 
308 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  35 
 
 
308 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  35 
 
 
308 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  35 
 
 
308 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  35 
 
 
308 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  35 
 
 
308 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  36.73 
 
 
304 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  33.99 
 
 
304 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  35.76 
 
 
309 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  35.89 
 
 
308 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  32.27 
 
 
307 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  34.97 
 
 
316 aa  185  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  34.49 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>