267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2885 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2885  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
321 aa  627  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  33.1 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
227 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.64 
 
 
243 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
225 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.36 
 
 
168 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.62 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  34.82 
 
 
563 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.34 
 
 
214 aa  59.3  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0179  cyclic nucleotide-binding protein  29.37 
 
 
155 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.13 
 
 
182 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  36.45 
 
 
577 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.56 
 
 
129 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11017  hypothetical protein  35.48 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.210732  normal  0.341372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
228 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.08 
 
 
226 aa  56.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 
224 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.89 
 
 
220 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 
226 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
219 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.67 
 
 
223 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3179  hypothetical protein  35.96 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  27.52 
 
 
739 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 
388 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 
332 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  27.03 
 
 
222 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
230 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
224 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 
171 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 
154 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
224 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 
226 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
224 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
224 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  41.46 
 
 
412 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
224 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  30.67 
 
 
226 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  39.02 
 
 
419 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
230 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3813  cAMP-dependent protein kinase - catabolite gene activator and regulatory subunit  29.6 
 
 
172 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.2 
 
 
225 aa  52.8  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
570 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.93 
 
 
242 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.46 
 
 
226 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 
219 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.69 
 
 
230 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35 
 
 
225 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.86 
 
 
155 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.87 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.27 
 
 
225 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.46 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  34.57 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2517  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.28 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0236  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.33 
 
 
179 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.754806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  42.86 
 
 
1065 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.47 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 
507 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  25.79 
 
 
747 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.89 
 
 
163 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
222 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.14 
 
 
236 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.53 
 
 
225 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  26.9 
 
 
413 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.66 
 
 
226 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1915  cyclic nucleotide-binding protein  32.67 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  0.183424 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  42.5 
 
 
412 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.67 
 
 
224 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 
228 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  33.58 
 
 
167 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.79 
 
 
225 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
226 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  29.47 
 
 
215 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  32.43 
 
 
154 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.05 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26 
 
 
224 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0787  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.08 
 
 
170 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
225 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  33.94 
 
 
155 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
223 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  27.37 
 
 
224 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.71 
 
 
224 aa  49.3  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.9 
 
 
224 aa  49.3  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 
417 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  36.54 
 
 
164 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  26.61 
 
 
225 aa  49.3  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>