92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2760 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2760  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.378531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  36.08 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  32.32 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  28.67 
 
 		 407 aa  57.8  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2511  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  32.43 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  30.61 
 
 		 355 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.08 
 
 		 243 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.45 
 
 		 232 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.14 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 		 223 aa  51.2  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  31.52 
 
 		 419 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 512 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  23.81 
 
 		 367 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  27.97 
 
 		 747 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.71 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  31.91 
 
 		 860 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  29.3 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  31.37 
 
 		 419 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  27.5 
 
 		 739 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  29.59 
 
 		 409 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2391  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  31.73 
 
 		 308 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  44.12 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  26.44 
 
 		 482 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 426 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  30.63 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  27.46 
 
 		 367 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 613 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  28.07 
 
 		 412 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.37 
 
 		 239 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  29.23 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0090  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247588  normal  0.0443693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.39 
 
 		 243 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  28.04 
 
 		 425 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  40.58 
 
 		 620 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  37.31 
 
 		 229 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 		 425 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 482 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  23.81 
 
 		 435 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.34 
 
 		 225 aa  45.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.33 
 
 		 1075 aa  44.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1753  cyclic nucleotide-binding protein  27.16 
 
 		 357 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4421  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 572 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  26.71 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  33.71 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0722  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.84 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000366193  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  26.21 
 
 		 528 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 858 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.25 
 
 		 1056 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2211  cyclic nucleotide-binding protein  36.23 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.0478668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  29.79 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.43 
 
 		 220 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28 
 
 		 409 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 645 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  27.59 
 
 		 241 aa  42  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0161  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 161 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 246 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 224 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 227 aa  42  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  27.37 
 
 		 482 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 239 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 222 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0233  cyclic nucleotide-binding protein  25.36 
 
 		 592 aa  41.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000891781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 224 aa  41.2  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.47 
 
 		 238 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  31.43 
 
 		 239 aa  41.2  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 		 243 aa  41.2  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  31.58 
 
 		 322 aa  40.8  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 645 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 239 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  26.97 
 
 		 226 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 645 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 645 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 		 226 aa  40.8  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06137  hypothetical protein  29.09 
 
 		 226 aa  40.8  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4140  cyclic nucleotide-binding protein  25.41 
 
 		 243 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>