205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4903 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  341  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4111  cyclic nucleotide-binding protein  65.64 
 
 		 163 aa  233  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  55.83 
 
 		 173 aa  187  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  55.21 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6054  cyclic nucleotide-binding protein  50 
 
 		 159 aa  167  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  57.89 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5297  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.05 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0179  cyclic nucleotide-binding protein  40.85 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3813  cAMP-dependent protein kinase - catabolite gene activator and regulatory subunit  35.51 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  33.61 
 
 		 739 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.9 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  35.05 
 
 		 731 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4818  cyclic nucleotide-binding protein  35.8 
 
 		 332 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931859  normal  0.928656 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  30.19 
 
 		 482 aa  52.4  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  27.87 
 
 		 286 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  30.39 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 229 aa  52  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2885  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.89 
 
 		 321 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.71 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  26.72 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 832 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  28.33 
 
 		 1053 aa  51.2  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1915  cyclic nucleotide-binding protein  34.57 
 
 		 329 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379435  normal  0.183424 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  22.4 
 
 		 721 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  26.72 
 
 		 214 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1731  hypothetical protein  29.46 
 
 		 376 aa  50.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  28.95 
 
 		 734 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.36 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.36 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  35.35 
 
 		 621 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  31.37 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  30.36 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  31.46 
 
 		 563 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  30.97 
 
 		 598 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.73 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  21.6 
 
 		 721 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  28.3 
 
 		 832 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  27.93 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  28.3 
 
 		 832 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.43 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  33.7 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 424 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  28.57 
 
 		 210 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  28.04 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 210 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  33.93 
 
 		 214 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  31.37 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  23.93 
 
 		 729 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 		 275 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  29.69 
 
 		 217 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  30.69 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  25.4 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  29.46 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  28.41 
 
 		 738 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.97 
 
 		 425 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  30.97 
 
 		 425 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.210732  normal  0.341372 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  24.6 
 
 		 214 aa  47.8  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  24.6 
 
 		 211 aa  47.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 243 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  24.6 
 
 		 211 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 227 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1127  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.02 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.871772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 		 367 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2686  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.43 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.640376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 227 aa  47.4  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2511  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  35.96 
 
 		 230 aa  47.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  26.76 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2344  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.71 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 		 482 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>