120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1996 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1996  cAMP-binding protein  100 
 
 		 1002 aa  2023    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0322  hypothetical protein  95.92 
 
 		 119 aa  191  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.25 
 
 		 1056 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 234 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  24.79 
 
 		 803 aa  68.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  26.05 
 
 		 939 aa  68.9  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0929  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.53 
 
 		 1010 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  25.41 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  23.96 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.5 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 		 231 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.17 
 
 		 225 aa  62.4  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 228 aa  61.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  33.79 
 
 		 226 aa  60.1  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.37 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  23.04 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 224 aa  57.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  23.24 
 
 		 458 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 439 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2039  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1002 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 236 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.3 
 
 		 225 aa  55.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 427 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 236 aa  54.7  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.95 
 
 		 322 aa  54.3  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 429 aa  54.3  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  27.01 
 
 		 419 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 257 aa  54.3  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 427 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  26.28 
 
 		 412 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 224 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 		 226 aa  53.9  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 427 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  24.8 
 
 		 436 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.73 
 
 		 243 aa  52.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.01 
 
 		 236 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  30.21 
 
 		 160 aa  52  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 243 aa  52  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 		 220 aa  51.6  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.99 
 
 		 225 aa  51.2  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1094 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.21 
 
 		 1148 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  25.2 
 
 		 166 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 		 151 aa  51.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  22.86 
 
 		 230 aa  50.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 		 242 aa  50.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.72 
 
 		 224 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.03 
 
 		 229 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  22.13 
 
 		 435 aa  50.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 248 aa  49.7  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  26.02 
 
 		 215 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 		 216 aa  49.7  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 		 225 aa  49.7  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.56 
 
 		 151 aa  49.7  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 254 aa  49.3  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4674  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1002 aa  49.3  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.597863  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0506  cyclic nucleotide-binding protein, putative  28.77 
 
 		 137 aa  48.9  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.191962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.02 
 
 		 1343 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.92 
 
 		 227 aa  48.9  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  26.02 
 
 		 215 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.62 
 
 		 228 aa  48.5  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 249 aa  48.5  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  48.5  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.76 
 
 		 524 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 		 357 aa  48.5  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.08 
 
 		 212 aa  48.5  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.39 
 
 		 228 aa  48.5  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 225 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 226 aa  48.5  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  29.69 
 
 		 151 aa  48.5  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 224 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 263 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1527  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 167 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000128576  hitchhiker  0.00383137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 		 286 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.26 
 
 		 226 aa  48.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 224 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2083  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 258 aa  47.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 246 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  28.79 
 
 		 442 aa  47.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.74 
 
 		 219 aa  47.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 225 aa  47.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.1 
 
 		 225 aa  47.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  28.21 
 
 		 231 aa  47  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 155 aa  47  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 236 aa  47  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 225 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.32 
 
 		 235 aa  47  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  24.36 
 
 		 450 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  25.85 
 
 		 154 aa  47  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1475  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 260 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 236 aa  46.2  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 236 aa  46.2  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 227 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  32.99 
 
 		 225 aa  45.8  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>