More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3764 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 151 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  96.03 
 
 		 151 aa  291  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  54.67 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  49.67 
 
 		 151 aa  157  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  42.25 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  42.25 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  41.73 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  39.46 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.88 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  40.15 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  37.93 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  43.88 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.24 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1664  cyclic nucleotide-binding protein  35.66 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  35.51 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  37.41 
 
 		 163 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1398  cyclic nucleotide-binding protein  40.29 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144588  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  37.9 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.1 
 
 		 155 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1854  cyclic nucleotide-binding protein  36.96 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1575  cyclic nucleotide-binding  36.96 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  35.1 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.96 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  31.72 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  34.38 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  30.77 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  33.05 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  30.07 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  33.61 
 
 		 194 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  32.79 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  35.48 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.71 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.5 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.43 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.86 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.5 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  29.8 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  35.19 
 
 		 621 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 624 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.24 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 225 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.75 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  32.11 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.47 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4030  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.21 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.5 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.75 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 472 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  34.02 
 
 		 251 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  34.02 
 
 		 251 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  34.02 
 
 		 251 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 251 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  34.02 
 
 		 251 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 246 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.46 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  31.3 
 
 		 419 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.93 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.01 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  33.33 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 1043 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.38 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  30.65 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>