34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1369 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  80.68 
 
 		 450 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  855    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  71.03 
 
 		 457 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  71.03 
 
 		 445 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  70.48 
 
 		 458 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  70.71 
 
 		 458 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  43.74 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 427 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  39.95 
 
 		 435 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  40.52 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  40.48 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 463 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  42.66 
 
 		 436 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 439 aa  239  9e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  36.28 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  34.71 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  27.11 
 
 		 939 aa  103  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  27.5 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  24.55 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49533  nucleotide transporter 1  26.9 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  23.55 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  22.03 
 
 		 666 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3729  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.48 
 
 		 909 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369293  normal  0.981995 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 73 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  24.53 
 
 		 803 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0929  HEAT repeat-containing PBS lyase  20.77 
 
 		 1010 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  22.82 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46794  nucleotide transporter 4  23.59 
 
 		 591 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0520076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>