20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3729 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3729  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
909 aa  1701    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369293  normal  0.981995 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  22.8 
 
 
939 aa  186  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  30.35 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  26.75 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4674  hypothetical protein  25.33 
 
 
1002 aa  67.4  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.597863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2039  hypothetical protein  23.23 
 
 
1002 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  31.75 
 
 
445 aa  57  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  31.22 
 
 
458 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  31.22 
 
 
458 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  26.43 
 
 
438 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  26.87 
 
 
450 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  27.22 
 
 
430 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.78 
 
 
1343 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  34.38 
 
 
442 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  26.55 
 
 
436 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.64 
 
 
1056 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  27.93 
 
 
427 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  23.25 
 
 
529 aa  46.2  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.22 
 
 
1139 aa  45.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.07 
 
 
370 aa  44.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>